شامل نوار کلار مانند از اپیتلیوم مطبق سنگفرشی غیر کراتینیزه است. در اوایل زندگی 3-4 لایه است و باافزایش سن به 10-20 لایه می رسد. جانکشنال اپی تلیوم از کرونال به اپیکال باریک می شود به طوریکه ازعرض 10-29 سلول در کرونال به عرض 1-2 سلول در انتهای اپیکالی که در بافت سالم درناحیه ی محل اتصال مینا و سمنتوم قرار دارد می رسد. این سلولها در دولایه قرار می گیرند لایه ی بازال روبروی بافت همبند ولایه ی سوپرابازال که به سطح دندان گسترش می یابد.طول اپی تلیوم جانکشنال رنجی از 0.25 تا 1.35 میلی متر است. اپی تلیوم جانکشنال از تلاقی اپی تلیوم دهانی و اپی تلیوم مینایی کاهش یافته حین رویش دندان ایجاد می شود. هرچند حضور اپی تلیوم مینایی کاهش یافته برای ایجاد پی تلیوم جاکشنال ضروری نیست و اپی تلیوم جانکشنال پس از جراحی یا اینسترومنتیشن پاکت و اطراف ایمپلنت ایجاد می شود.